El Bioingeniero podrá aplicar sus competencias profesionales en todo tipo de proyectos de biotecnología, ingeniería biomédica y medio ambiente. Su desempeño incide en el sector público en dependencias de los tres niveles de gobierno y organismos descentralizados, en el sector privado o como profesional independiente.
En el sector público:

a) Sector salud
b) En instancias reguladoras
c) Instituciones de Educación y Centros de Investigación
d) Dependencias de gobierno
e) En trabajos de mejoramiento del medio ambiente y aprovechamiento de
recursos naturales.
f) En organismos que impulsan el desarrollo agropecuario
g) Otras dependencias y entidades en el ámbito federal, estatal y municipal.

En el sector privado:

a) Sector salud
b) Sector educativo
c) Departamentos de Investigación y Desarrollo
d) En la industria de fabricación de materiales y equipo médico
e) En la industria biotecnológica
f) En la industria del medio ambiente
g) Empresas de servicios

Como profesional independiente en:

a) Asesoría y capacitación de personal en el área de la bioingeniería.
b) Realizando estudios y proyectos en el área bioingenieril.
c) Prestación de servicios profesionales independientes en el área.